根据食品行业洁净室相关规范，及业主方生产工艺和实际需求，考虑人流、物流合理配置和人体舒适的需求，实地结合建筑楼宇的结构，进行净化车间平面布局设计。一般而言，食品中央加工洁净厂房，包括以下主要洁净车间和功能间。
功能间:洗手消毒间，更衣室，拆包间，前处理间，煮料间，冷品分拣间，冷冻间，冷藏间，烤盘清洗间，器具中转间，原料仓库，包材仓库，蛋液油脂冷藏间，油罐间，模具清洗间，面团运输车清洗间，物资调度室，物资待检、发货间等其他区域。
洁净车间:西点加工间冷冻间，裱花房冷冻间，裱花房冷藏间，常温加工间，常温面包加工间，冷冻半成品手工面包加工间，制馅间，发酵室，常温蛋糕加工间，配料间，原料前处理间，原料初加工间，原料精加工间，烘烤间，预冷间，冷却间等。
空调通风系统:食品净化车间的空调通风系统，依照洁净室暖通设计的原理和相应的行业洁净度等级要求（食品车间通常为10万级空气洁净度），来设计净化车间暖通系统包括空调制冷量、送回风量及循环次数、排风量、新风量。
采用的空调通风设备，主要包含空调室外主机、净化组合式风柜，中效过滤新风柜，离心排风柜，轴流排风机及末端高效过滤器出风口等。
由于食品车间不同生产工艺需求，设定不同温湿度，如发酵室为温度38℃湿度80%；而蛋糕裱花车间环境温度则要求偏低，确保成品的美观和保存；面包生产线车间因为有烤炉等散发热量的烘烤设备，需要给房间更多的冷量输送，利于人员工作的舒适健康。
车间围护结构
隔墙：一般采用净化彩钢板建造，根据间隔功能，可使用双面不锈钢玻镁彩钢板和单面不锈钢玻镁彩钢板，不锈钢净化门带双层视窗和不锈钢自由门，双层真空钢化玻璃视窗等。
天花：可使用单面不锈钢玻镁彩钢板，冷库区域使用聚氨酯彩钢板天花。
地面：根据不同区间使用情况，可使用4㎜聚氨酯地面、超耐磨地面，涉及到排水区域需使用不锈钢材质的排水槽和盖板。
照明系统
一般净化车间主要作业区域按300Lux布置照明系统，非作业区域可按200Lux，采用罩式净化灯、净化灯（带应急照明）、圆形吊杆防爆灯和紫外线杀菌灯等。
